En el departamento de Madre de Dios, existe variedad de grupos étnicos que muestran pronunciada identidad , por lo que se diferencian notoriamente unos de otros.
Según la fuente de información por parte de los Padres Dominicos, existen 05 grupos étnicos principales en nuestro Departamento siendo éstos los siguientes.
- GRUPO NATIVO MACHIGUENGAS
Este es uno de los grupos más numerosos, su origen aún constituye un misterio, y por ello su historia se encuentra incompleta. Se dice que los Incas trataron de conquistarlos ocupando gran extensión territorial, desde el límite Este y Norte-Este del Cusco, comprendiendo la provincia de Paucartambo hasta el Departamento de Madre de Dios. Son de rasgos suaves, tez morena, de estatura alta, de carácter alegres. Se pintan el rostro con achiote, usan coronas de plumas, collares de semillas y dientes de mono. Estos estan ubicados en el Urubamba Echarate La Convención Cusco Afluente Manu Río Tambo, Satipo, Junín, Payeti, Fitzcarrald y Manu Manu Madre de Dios - GRUPO NATIVO ESE’EJA (HUARAYOS)
Este grupo nativo ha tenido mucho más contacto con la civilización Occidental en razón de su ubicación geográfica. Su familia lingüística es Tacana, conserva su sistema nómade aunque han formado dos comunidades: Palma Real e Infierno. La comunidad de Palma Real, está ubicada a orillas del Río Madre de Dios, a 1,30 horas, viajando en canoa con motor fuera de borda con respecto a Puerto Maldonado. - GRUPO NATIVO AMARAKAIRE
Se encuentra ubicado al Oeste de Puerto Maldonado, entre las riberas de los ríos Madre de Dios, Colorado e Inambari. - GRUPO NATIVO HUACHIPAERIS
Este grupo es de tradición guerrera, se dice que asolaban los valles de Paucartambo, viven desnudos, pintados con huito y palmas clavadas en las mejillas y labios, se ubican en la zona de Kosñipata en Paucartambo y Shintuya en Manu. - GRUPO NATIVO DE LOS MASHCOS
Este grupo está integrado por feroces guerreros , quienes se hacen incisiones en los labios, para luego colocarse plumas de colores, este grupo tiene cierta rivalidad con las tribus anteriores. Se encuentran ubicados en las zonas del Inambari, Manu y Colorado.
Producto del contínuo contacto con el mundo moderno, las poblaciones nativas, van destruyendo otros horizontes, abandonando todo lo que fue su cultura, llegando incluso en algunos, a avergonzarse de su idioma y además manifestaciones; aprendiendo el idioma castellano.
La Federación Nativa de Madre de Dios, tiene programas de apoyo a las poblaciones nativas, pero el escaso aporte no conlleva a la constitución de un grupo organizado donde defienda sus propias costumbres, tradiciones e idioma.